140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3441 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  63.16 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  63.16 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  63.16 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  60.96 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.7 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.81 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  53.85 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  57.01 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  48.89 
 
 		 245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  49.33 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  50.47 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.64 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  43.61 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  43.64 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.09 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  38.84 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  38.64 
 
 		 376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  41.74 
 
 		 343 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.94 
 
 		 372 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.94 
 
 		 372 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  41.94 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  41.85 
 
 		 387 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  40.09 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  36.96 
 
 		 374 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.67 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.09 
 
 		 376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  35.93 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  38.16 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.36 
 
 		 396 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.4 
 
 		 371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.22 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  37.66 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.83 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.09 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  34.51 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  39.53 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  36.29 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  40 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  35.78 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  41.56 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.21 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  36.64 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  35.35 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  38.77 
 
 		 365 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.77 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  37.34 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.3 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  31.16 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  42.13 
 
 		 383 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  38.05 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  36.9 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  38.43 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  38.32 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.18 
 
 		 401 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  35.71 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  29.25 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.78 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  36 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  29.44 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  30.73 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  36.89 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  33.9 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.04 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  37.79 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  32.86 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  36.16 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.71 
 
 		 399 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.76 
 
 		 389 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  33.94 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  38.62 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  35.94 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.12 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  29 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  38.86 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  38.79 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  34.22 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  25.91 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  36.41 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.97 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  38.36 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  41.18 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.05 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.94 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.93 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  38.01 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  29.72 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  41.45 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  29.81 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1499  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.57 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  34.1 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  38.01 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  30.7 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  28.02 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>