145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1253 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  51.11 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  60.26 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  68.7 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  52.44 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  60.53 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  56.83 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  54.7 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  59.21 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  57.78 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  57.94 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  57.02 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  55.11 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  50 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.64 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  60 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.56 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.77 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  52.65 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.77 
 
 		 231 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.84 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  53.78 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  56.19 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.22 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  52.89 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  53.33 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  59.11 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  52.12 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  48.44 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  52.12 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  55.31 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  48 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  53.64 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  51.06 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  57.78 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.78 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  46.7 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  54.82 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  50.21 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.07 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  52.77 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  51.74 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  48.12 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  50.64 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.06 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  54.82 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  40.83 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  34.88 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  36.73 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.67 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  46.67 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  49.4 
 
 		 190 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  50.71 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  47.62 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  34.53 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  34.96 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  38.99 
 
 		 357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  35.78 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  35.78 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.28 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  37.61 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  54.67 
 
 		 160 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.38 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  37.79 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.69 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  49.44 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  32.43 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  38.17 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  41.14 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  47.22 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  42.4 
 
 		 343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  31.48 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.01 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  35.9 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  41.71 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  39.09 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  43.08 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.88 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  40.09 
 
 		 372 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  34.91 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  34.91 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  34.91 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  40.18 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  52.54 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.09 
 
 		 372 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40 
 
 		 208 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.09 
 
 		 372 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  34.88 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  34.88 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.41 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  47 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.76 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  32.34 
 
 		 274 aa  91.7  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.53 
 
 		 371 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2681  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.78 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415823  normal  0.241923 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  34.98 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>