162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
232 aa  455  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.22 
 
 
242 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  58.02 
 
 
240 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  54.91 
 
 
241 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.31 
 
 
246 aa  194  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.22 
 
 
238 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  53.99 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  46.95 
 
 
233 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  40.38 
 
 
227 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  46.46 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.36 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  43.66 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  40.38 
 
 
229 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  47.06 
 
 
242 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  39.25 
 
 
228 aa  167  9e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  46.52 
 
 
233 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  42.59 
 
 
227 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  54.17 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  50.44 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  42.25 
 
 
226 aa  164  9e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  48.66 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  50.93 
 
 
230 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  39.64 
 
 
226 aa  161  9e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  39.64 
 
 
226 aa  161  9e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  45.79 
 
 
231 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  45.79 
 
 
228 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.83 
 
 
231 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.35 
 
 
234 aa  158  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  49.11 
 
 
235 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  42.33 
 
 
233 aa  158  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  46.26 
 
 
239 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  45.98 
 
 
233 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  45.29 
 
 
233 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  49.74 
 
 
231 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  43.75 
 
 
233 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  50.23 
 
 
229 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  44.39 
 
 
233 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  49.38 
 
 
231 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.54 
 
 
240 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  35.65 
 
 
226 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  41.18 
 
 
227 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  45.5 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  46.7 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  47.3 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  46.79 
 
 
231 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.24 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  44.24 
 
 
263 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  44.25 
 
 
235 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  44.25 
 
 
235 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.73 
 
 
231 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.39 
 
 
232 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  35.51 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  35.51 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  35.51 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  41.78 
 
 
245 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  41.78 
 
 
245 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  41.78 
 
 
245 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  48.21 
 
 
231 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  49.08 
 
 
235 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  46.48 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  37.56 
 
 
376 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  39.32 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  41.33 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  46.64 
 
 
234 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  41 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  43.95 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  35.8 
 
 
357 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.99 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  38.39 
 
 
374 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.77 
 
 
254 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1182  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.2 
 
 
203 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127344  normal  0.220028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  41.45 
 
 
343 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.35 
 
 
235 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.52 
 
 
208 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.74 
 
 
265 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  45.28 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.22 
 
 
376 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  44.05 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  42.15 
 
 
239 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  49.77 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  39.25 
 
 
249 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2681  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.59 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415823  normal  0.241923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  45.05 
 
 
231 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  40.61 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.93 
 
 
235 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  50 
 
 
323 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  40.99 
 
 
230 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.99 
 
 
230 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  41.67 
 
 
190 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  45 
 
 
160 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  36.53 
 
 
372 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  44.39 
 
 
211 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.53 
 
 
372 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.53 
 
 
372 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.12 
 
 
371 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  39.46 
 
 
371 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.16 
 
 
396 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>