143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1963 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  73.39 
 
 		 233 aa  304  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  69.6 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  69.16 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  77.16 
 
 		 235 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  64.38 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  67.69 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  64.38 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  65.18 
 
 		 228 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  69.53 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  65.35 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  69.1 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  66.67 
 
 		 232 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  63.44 
 
 		 229 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  67.81 
 
 		 231 aa  257  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  63.09 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  63.88 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  67.81 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  65.55 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  67.84 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  63.95 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  65.02 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  53.15 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  56.14 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  58.59 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  52.36 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  63.11 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.96 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  67.4 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  71.56 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  61.21 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  54.91 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  61.67 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  54.02 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  55.16 
 
 		 263 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  58.22 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  63.88 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  58.93 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.93 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  56.63 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  52.89 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.07 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.7 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  48.66 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  61.11 
 
 		 166 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  68.18 
 
 		 160 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  53.33 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.54 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  53.42 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  50.45 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.61 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  46.96 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  50 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.11 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  44.35 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  37.04 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  42.79 
 
 		 357 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.78 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  48.39 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  35.75 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  46.05 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  35.45 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  52.17 
 
 		 343 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  37.79 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  38.53 
 
 		 376 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.06 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  45.11 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.18 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  41.52 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  33.62 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  34.36 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  46.61 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  32.88 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  32.88 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  40.37 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  38.26 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.34 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  35.5 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  35.5 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  35.5 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.37 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  38.5 
 
 		 371 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  42.33 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  28.25 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  40.36 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.43 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.37 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  37.72 
 
 		 368 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40 
 
 		 372 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40 
 
 		 372 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  34.36 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.57 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  34.92 
 
 		 376 aa  92  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  46.3 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  51.38 
 
 		 365 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  31 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  31 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  35.03 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.41 
 
 		 371 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>