146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3122 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  74.12 
 
 		 228 aa  337  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  73.16 
 
 		 231 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  71.49 
 
 		 232 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  65.8 
 
 		 231 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  67.54 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  67.97 
 
 		 231 aa  274  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  65.35 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  65.5 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  65.8 
 
 		 231 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  67.53 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  66.22 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  65.18 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  64.73 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  62.11 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  62.56 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  58.15 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  66.67 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  59.82 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  53.12 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.03 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  54.3 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  57.14 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  59.38 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  49.12 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  59.03 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  60.96 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  58.59 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  55.51 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  54.19 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.67 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  55.56 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  55.2 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  61.04 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  61.16 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.7 
 
 		 246 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.57 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  54.05 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  52.86 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  55.22 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  59.24 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.42 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  54.42 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  53.65 
 
 		 190 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.34 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  43.86 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  52.17 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  49.33 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.37 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  46.52 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  54.19 
 
 		 166 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  44.89 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  52.03 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  33.78 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  59.48 
 
 		 160 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.96 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  33.63 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 357 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.62 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  33.94 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.33 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  36.49 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  34.7 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  38.81 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  45.41 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  41.82 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  36.7 
 
 		 376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  46.12 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  41.47 
 
 		 343 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.51 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.21 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  43.64 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  38.14 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  37.56 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  42.95 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  32.29 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  32.29 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.51 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  38.85 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.07 
 
 		 376 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  31.5 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  38.22 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  36.99 
 
 		 371 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  29.09 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  40.27 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.78 
 
 		 372 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.78 
 
 		 372 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.32 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  45.33 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  31.71 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2681  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.78 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415823  normal  0.241923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  52.8 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.6 
 
 		 396 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.44 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.24 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  29.28 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.88 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>