136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0494 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  66.37 
 
 
226 aa  305  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  62.56 
 
 
230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  54.63 
 
 
227 aa  244  9e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  54.63 
 
 
227 aa  244  9e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  39.55 
 
 
232 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  37.5 
 
 
226 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  34.09 
 
 
226 aa  153  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  34.09 
 
 
226 aa  153  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  36.11 
 
 
227 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  36.28 
 
 
228 aa  148  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  40.81 
 
 
241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.77 
 
 
246 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  32.29 
 
 
227 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  37.61 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.18 
 
 
242 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.5 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  31.25 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  36.92 
 
 
237 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  36.73 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  37.22 
 
 
235 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.19 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  35.48 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  34.26 
 
 
233 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.25 
 
 
236 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  34.26 
 
 
233 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  33.19 
 
 
233 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  33.17 
 
 
242 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  35.81 
 
 
243 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.99 
 
 
240 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  32.61 
 
 
233 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  31.02 
 
 
230 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  33.02 
 
 
239 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  31.42 
 
 
231 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  35.09 
 
 
231 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  39.72 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.57 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  40.28 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  34.55 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  38.79 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.71 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  29.78 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  28.7 
 
 
376 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  33.04 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  30.73 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  94.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  29.96 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.94 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  30.62 
 
 
263 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.72 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  31.86 
 
 
231 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  29.63 
 
 
374 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  34.42 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  36.22 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  29.52 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  28.89 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.86 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  32.74 
 
 
235 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.91 
 
 
254 aa  88.6  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  31.14 
 
 
233 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  32.3 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  31.3 
 
 
233 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  37.34 
 
 
234 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  36.54 
 
 
190 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.44 
 
 
376 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  38.02 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1182  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.07 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127344  normal  0.220028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  27.06 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  28.64 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  30.94 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.03 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  41.03 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.38 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.38 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.28 
 
 
371 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  37.38 
 
 
160 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  36.99 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.36 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  27.48 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  27.78 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  27.15 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  27.15 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  27.15 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  26.24 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  33.06 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  27.83 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.67 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  36.52 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.39 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.72 
 
 
360 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  25.66 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  31.45 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.56 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.98 
 
 
361 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.31 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.58 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  27.1 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>