140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1182 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1182  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 
203 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127344  normal  0.220028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.15 
 
 
242 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  47.2 
 
 
232 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.91 
 
 
208 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  45.53 
 
 
240 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  39.25 
 
 
228 aa  127  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.24 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  41.92 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  45.66 
 
 
237 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  39.17 
 
 
227 aa  124  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  42.06 
 
 
243 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.82 
 
 
246 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.21 
 
 
229 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.02 
 
 
240 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  37.38 
 
 
229 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  33.49 
 
 
227 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  48.62 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  32.88 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  36.24 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  108  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  108  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  37.33 
 
 
233 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1132  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.38 
 
 
196 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.44002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.55 
 
 
254 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  36.44 
 
 
263 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  34.07 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  40.1 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  33.02 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  35.59 
 
 
228 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  35.91 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  36.41 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  37.67 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  36.16 
 
 
357 aa  91.3  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  38.29 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  33.78 
 
 
376 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  37.44 
 
 
233 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  43.06 
 
 
250 aa  87.8  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  36.04 
 
 
250 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  36.82 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.53 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  55 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.78 
 
 
376 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  55 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.04 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.94 
 
 
236 aa  85.1  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  31.48 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  56.1 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  51.58 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  39.24 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  59.49 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  59.49 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.49 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  66.67 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  55.84 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  32.49 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  36.65 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  69.23 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  29.82 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  29.82 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  45.19 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  62.12 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  37.96 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  31.53 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.32 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  32.13 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  64.62 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  35.45 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  35.02 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  42.24 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  34.73 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  34.73 
 
 
235 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.67 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.67 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  35.71 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.11 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  31.51 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  52.78 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  36.24 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  33.02 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  32.26 
 
 
365 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  35.53 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.42 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  31.88 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  29.86 
 
 
387 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.49 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  31.48 
 
 
368 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  60.71 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  60.56 
 
 
239 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.32 
 
 
396 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.94 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  59.42 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.42 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  32.87 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  35.92 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.48 
 
 
235 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  34.43 
 
 
383 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>