133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1508 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  62.56 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  56.7 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  53.6 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  53.6 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  42.6 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  41.89 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  35.43 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  35.43 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  36.94 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  35.56 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.4 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  42.92 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  41.33 
 
 		 241 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  35.51 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.01 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  33.78 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.5 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  39.83 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  35.65 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  34.78 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  36.23 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  36.41 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.44 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  34.68 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  38.01 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  32.31 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  33.62 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  32.77 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  31.28 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  31.58 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  34.05 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  36.28 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  32.31 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  35.09 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  30.87 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  32.75 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  39.46 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.5 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  34.22 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.5 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  38.85 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.49 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  31.44 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.3 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.62 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  35.81 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  34.05 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  29.33 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  32.59 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  35.14 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  30.28 
 
 		 376 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  32.02 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  33.04 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  38.85 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  32.3 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  32.29 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  31.86 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  28.89 
 
 		 357 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  36.15 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1182  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.02 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127344  normal  0.220028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  32.43 
 
 		 374 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.22 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.61 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.63 
 
 		 376 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  38.28 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  29.41 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.21 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  38.21 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  32.68 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  33.77 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.69 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.69 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  32.39 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.73 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  32.7 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  32.03 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.46 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  35.95 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  32.26 
 
 		 270 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  27.57 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  28.5 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  28.5 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  28.5 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  29.09 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  27.31 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  36.43 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  29.35 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  37.28 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.37 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.15 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  23.68 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4153  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.76 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  23.68 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.38 
 
 		 360 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>