80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4153 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4153  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 187 aa  362  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2681  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.58 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415823  normal  0.241923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.84 
 
 		 229 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.66 
 
 		 238 aa  90.9  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  42.58 
 
 		 240 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  38.06 
 
 		 237 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  33.97 
 
 		 241 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.54 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.5 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  26.06 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  28.34 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  34.3 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  26.62 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.41 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.82 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  26.11 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  27.75 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  35.71 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  39 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  28.74 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.62 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  38.18 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  25.6 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  26.16 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  28.49 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  30.47 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  30.97 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  20.81 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  20.81 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  34.01 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  35.34 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  30.95 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  33.07 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  30.94 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  29.11 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  28.76 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  30.08 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  27.78 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.58 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  30.53 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  27.22 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  26.56 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  26.56 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  32.28 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  32 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  22.44 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  32.56 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  32.76 
 
 		 233 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  31.54 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.08 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  26.39 
 
 		 280 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  36.08 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.4 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.55 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  36.13 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  35.65 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  30.06 
 
 		 374 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  33.67 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  29.95 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  27.4 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.73 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.49 
 
 		 358 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  28.91 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  28.16 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  29.13 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  30.11 
 
 		 343 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  27.45 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  32.94 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  44 
 
 		 323 aa  44.7  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.12 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.75 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  20 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.42 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.25 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  30.3 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  32.56 
 
 		 231 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  28.75 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>