120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5570 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  80.09 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2142  hypothetical protein  72.73 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  61.84 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.96 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1499  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.09 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.01 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67039  predicted protein  38.29 
 
 		 300 aa  153  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03681  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  43.65 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0906032  normal  0.0956123 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04690  membrane fraction protein, putative  35.6 
 
 		 383 aa  125  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  30.52 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04990  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  36.61 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.267211 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  29.69 
 
 		 280 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  33.01 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  30.84 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  31.02 
 
 		 357 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  35.24 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  32.86 
 
 		 280 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  30.84 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  30.84 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  28.88 
 
 		 376 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  30.47 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  30.4 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  28.24 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.63 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  34.41 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  30.56 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  30.68 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  30.68 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  30.68 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  28.9 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  29.68 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.7 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  27.75 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.28 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.57 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  30.9 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  24.03 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.87 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.56 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.5 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.79 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1636  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  hitchhiker  0.00000056751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.3 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.37 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.02 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  32.69 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  32.13 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  28.44 
 
 		 368 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.13 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  30.36 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  28.08 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  24.14 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  27.78 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  28.32 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  28.83 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  26.27 
 
 		 371 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.31 
 
 		 372 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.31 
 
 		 372 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.24 
 
 		 371 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  25.45 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  27.71 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  27.31 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.82 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  27.8 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  27.65 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  28.33 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43313  predicted protein  26.92 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43314  predicted protein  25.23 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  27.83 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  25.15 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  28.14 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  25.66 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.63 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  26.54 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  27.16 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  29.27 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  27.75 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.34 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  27.35 
 
 		 319 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  27.33 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  30.94 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  19.72 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  24.57 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  30.36 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.44 
 
 		 396 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.66 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  32.41 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>