66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0522 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.89 
 
 
352 aa  266  4e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  30.26 
 
 
362 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  33.05 
 
 
374 aa  150  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.3 
 
 
358 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.82 
 
 
361 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.65 
 
 
396 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.12 
 
 
285 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  35.42 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  27.79 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  24.51 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.54 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  25.14 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  27.53 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  26.11 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  25 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  27 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.59 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.59 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  26.87 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  24.5 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.67 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  22.4 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.42 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  23.03 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  23.49 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  23.17 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.47 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  30.81 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.9 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  30.27 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.43 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.47 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  23.95 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.52 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  23.38 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  24.36 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.55 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  23.02 
 
 
291 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.73 
 
 
399 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  21.68 
 
 
376 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  24.84 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  26.99 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.57 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.99 
 
 
371 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.44 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  21.53 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  26.29 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  21.53 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  27.35 
 
 
231 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  26.79 
 
 
231 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.44 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  21.56 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03681  Vacuolar Fe2+/Mn2+ transporter, putative (Eurofung)  24.73 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0906032  normal  0.0956123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2142  hypothetical protein  23.2 
 
 
231 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  21.67 
 
 
227 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.29 
 
 
247 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  26.26 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  22.87 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67039  predicted protein  24.35 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  24.2 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  31.31 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1499  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.83 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>