48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1809 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  565  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  58.45 
 
 
284 aa  338  8e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  58.45 
 
 
284 aa  338  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  47.86 
 
 
291 aa  281  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.92 
 
 
291 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.65 
 
 
285 aa  275  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.27 
 
 
291 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.29 
 
 
291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  49.25 
 
 
292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  47.39 
 
 
291 aa  269  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.39 
 
 
289 aa  269  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  46.76 
 
 
291 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.28 
 
 
293 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  48.61 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.59 
 
 
300 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  49.31 
 
 
297 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  45.99 
 
 
293 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.02 
 
 
292 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  37.72 
 
 
287 aa  202  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  33.44 
 
 
297 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  32.11 
 
 
297 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  30.64 
 
 
299 aa  142  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  31.79 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  33.85 
 
 
374 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.64 
 
 
358 aa  89.7  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  26.63 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.58 
 
 
352 aa  79  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.72 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  23.49 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  26.94 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  27.37 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.84 
 
 
360 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.94 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  24.76 
 
 
365 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  30.88 
 
 
232 aa  46.2  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.84 
 
 
389 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  26.34 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  32 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  26.47 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2558  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.58 
 
 
181 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  23.32 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  29.87 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.85 
 
 
399 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  24.87 
 
 
383 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  23.32 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.47 
 
 
234 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>