More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1039 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5639  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3991  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0793051  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2805  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.38 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.8 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.11 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.62 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.62 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.62 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.7 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.86 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.94 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.53 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.94 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  36.36 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.35 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  35.54 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  23.5 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  31.15 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.02 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  32.04 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  36.19 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  34.43 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.94 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.22 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  37.14 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  27.18 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  32.99 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.66 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.38 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  24.35 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.48 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  21.08 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 340 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.27 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.77 
 
 		 371 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  26.85 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  40.91 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 345 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  21.84 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.4 
 
 		 288 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.38 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  34.95 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>