256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0384 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  50.63 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.84 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  36.78 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  37.66 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  37.5 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.55 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.17 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.25 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  36.78 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.62 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  37.34 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.77 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  43.11 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  43.11 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  43.11 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  32.48 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  43.11 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  43.37 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.05 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  43.29 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  41.92 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  41.92 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  43.29 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  41.92 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.49 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.82 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  33.91 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  35.77 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.35 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.34 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.12 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.38 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.6 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  31.98 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  34.71 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  31.09 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  31.09 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.62 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.17 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  31.44 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  32.62 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  31.44 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.04 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.29 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.9 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  30.53 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.84 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  28.21 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  30.53 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.08 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.82 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.4 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.84 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.76 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.84 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.67 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.49 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  30.18 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.72 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  29.52 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.34 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.15 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  30.18 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  33.05 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  29.52 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.78 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  27.47 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.84 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  29.13 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  31.28 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.78 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.33 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  28.33 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  29.28 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.73 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.33 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.9 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.9 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.9 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  26.61 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  31.33 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.9 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.53 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  28.38 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  27.8 
 
 		 283 aa  98.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.2 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.58 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.47 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  26.58 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  29.96 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>