More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3391 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 517 aa  1081    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  43.84 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  47.24 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  45.31 
 
 		 516 aa  468  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  42.66 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  41.36 
 
 		 519 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  41.33 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  40.86 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  40.47 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  40 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  40.59 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  39.96 
 
 		 519 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  38.43 
 
 		 522 aa  378  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  30.02 
 
 		 527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  31.41 
 
 		 512 aa  299  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.63 
 
 		 518 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.49 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  25.84 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  26.1 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.46 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  25.84 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  25.85 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  25.85 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  25.85 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.88 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  25.85 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.79 
 
 		 506 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  25.85 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.51 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  25.83 
 
 		 511 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  26.82 
 
 		 508 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.63 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  26.79 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.08 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.95 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  27.07 
 
 		 505 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.62 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.81 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.65 
 
 		 502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.36 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.08 
 
 		 511 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.21 
 
 		 500 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.82 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  26.65 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  24.32 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  25.54 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  26.31 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.45 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  26.16 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  26.12 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.29 
 
 		 496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.55 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.87 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.24 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.3 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.56 
 
 		 499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  24.71 
 
 		 514 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.36 
 
 		 513 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.55 
 
 		 513 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.55 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.8 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.1 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.55 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  27.15 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  24.3 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.11 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.55 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.62 
 
 		 497 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.1 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  24.95 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  27.27 
 
 		 438 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  25.14 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  25.14 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.16 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  25.29 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  25.14 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  25.82 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.48 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  25.98 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  24.56 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  23.98 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  23.02 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  25.49 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  25.34 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  24.52 
 
 		 514 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  24.04 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.53 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  24.52 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  23.68 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.28 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  25.61 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>