153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2941 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2941  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  989    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000189164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1309  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  38.51 
 
 
481 aa  354  2e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2040  sugar/sodium symporter  39.14 
 
 
479 aa  353  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0696  sugar transporter, putative  36.52 
 
 
516 aa  315  8e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.03 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.83 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  22.15 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  21.57 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.98 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.41 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.53 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  23.21 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  21.71 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.57 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  22.42 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.06 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  22.74 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.31 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.83 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.01 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.01 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  23.19 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.21 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.21 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.21 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.86 
 
 
461 aa  67  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  19.78 
 
 
480 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  21.94 
 
 
467 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  22.17 
 
 
457 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  22.2 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  22.2 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.12 
 
 
454 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  22.17 
 
 
457 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  22.17 
 
 
457 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  22.86 
 
 
467 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  21.03 
 
 
465 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  21.46 
 
 
461 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  20.69 
 
 
454 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  22.78 
 
 
511 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  22.27 
 
 
442 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  22.17 
 
 
457 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.17 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.64 
 
 
441 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.94 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.93 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.64 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  21.98 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  21.98 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.71 
 
 
442 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  21.98 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  23.47 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  21.98 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.91 
 
 
478 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  21.76 
 
 
476 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  22.04 
 
 
471 aa  60.1  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  22.41 
 
 
457 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  39.24 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.7 
 
 
477 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  20.93 
 
 
462 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  28.7 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  28.7 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  28.7 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  28.7 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.81 
 
 
476 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.43 
 
 
469 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  32.53 
 
 
538 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  18.18 
 
 
475 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  20.15 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.77 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  24.1 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  23.48 
 
 
461 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  25.35 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  22.8 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  24.1 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  22.17 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  24.1 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  22.91 
 
 
472 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  24.1 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  28.36 
 
 
522 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.58 
 
 
640 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  22.46 
 
 
486 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  23.12 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  23.12 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  23.12 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  21.47 
 
 
493 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  21.99 
 
 
470 aa  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  18.1 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  29.23 
 
 
479 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.9 
 
 
544 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>