More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2077 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 335 aa  675    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0538  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.06 
 
 		 338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.331453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1537  histidine kinase  41.64 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.496885  normal  0.0588586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1154  histidine kinase  34.92 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0560  histidine kinase  29.94 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0919197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0742  histidine kinase  33.22 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 605 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 451 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  27.56 
 
 		 601 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 451 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  27.56 
 
 		 589 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 723 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 462 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  29.46 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  26.2 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  27.1 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2147  histidine kinase  29.26 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.05 
 
 		 503 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  23.75 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 920 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  25.93 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  28.86 
 
 		 540 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 307 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  26.85 
 
 		 481 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 470 aa  99.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  27.09 
 
 		 449 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.8 
 
 		 462 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 444 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 331 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 463 aa  99.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  27.23 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  25.69 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  25.86 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  25.69 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  27.23 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  25.69 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  27.23 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 680 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  25.37 
 
 		 518 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 465 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  25.69 
 
 		 431 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  27.23 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 608 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  26.22 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 597 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  27.23 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 596 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  25.69 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  25.35 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 509 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  25.69 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 413 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  27.67 
 
 		 463 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 584 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 487 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 815 aa  96.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 469 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  27.8 
 
 		 477 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 869 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 478 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  26.48 
 
 		 352 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 482 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  28.09 
 
 		 477 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 379 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 578 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 379 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 455 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.67 
 
 		 745 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 785 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  27.4 
 
 		 745 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 585 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 571 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.02 
 
 		 1501 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  25.61 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.8 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 476 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  30.19 
 
 		 480 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  29.1 
 
 		 443 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 700 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 610 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  25.98 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  25.24 
 
 		 501 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  27.71 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  25.08 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  27.7 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 597 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 466 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  29.1 
 
 		 443 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  27.23 
 
 		 382 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  29.17 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11101  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  26.61 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.330721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>