More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0742 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0742  histidine kinase  100 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0538  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.331453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1537  histidine kinase  28.52 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.496885  normal  0.0588586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1154  histidine kinase  35.48 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  28.51 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 456 aa  92.8  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 476 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  29.66 
 
 		 596 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 		 375 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0718  histidine kinase  31.62 
 
 		 386 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  28.69 
 
 		 370 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 596 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 444 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 682 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  23.14 
 
 		 458 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0560  histidine kinase  27.96 
 
 		 341 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0919197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.2 
 
 		 447 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  26.76 
 
 		 481 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 463 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 457 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 445 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 451 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  26.87 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  33.94 
 
 		 565 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 451 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 439 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  28.44 
 
 		 614 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  27.05 
 
 		 486 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 408 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2282  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 637 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.725476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  23.48 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  30.99 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 589 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12411  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  28.85 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  29.36 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  24.77 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  24.77 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  24.77 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  25.34 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  26.12 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  24.58 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  27 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  28.64 
 
 		 480 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  27.07 
 
 		 779 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  24.3 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.51 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  25.1 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  24.64 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.76 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  21.69 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  25.21 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 889 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  25.96 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0448  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  24.91 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  25.81 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  25.96 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  27.16 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  25.45 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 615 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 582 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 465 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  23.29 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  26.39 
 
 		 482 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  26.43 
 
 		 590 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  26.82 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  23.68 
 
 		 450 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>