More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1206 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 357 aa  722    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  30.66 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  28.93 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  28.93 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  27.35 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  28.37 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.22 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  30.49 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 660 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  29.61 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 392 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.4 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.07 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.4 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.75 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 669 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  30.05 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.42 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  26.7 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 443 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.55 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 678 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  28.42 
 
 		 435 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 890 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 762 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.16 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  26.32 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 808 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  22.72 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  26.83 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  26.83 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  26.56 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  25.35 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.25 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.69 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  27.3 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>