More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0549 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 		 251 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  43.2 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  39.32 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  41.63 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  39.9 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 206 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.26 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  39.8 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  37.21 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 		 245 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.44 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.59 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.42 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  38.65 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.95 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.92 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  36.32 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.82 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  36.02 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  38.65 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  36.67 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.14 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.14 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.14 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.14 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.14 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  35.55 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  35.1 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  36.63 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  36.63 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  36.63 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  34.6 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.18 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>