More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1306 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  100 
 
 
261 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  54.47 
 
 
259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  57.32 
 
 
262 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  55.69 
 
 
262 aa  279  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  53.17 
 
 
280 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  50.2 
 
 
262 aa  262  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  51.01 
 
 
262 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
246 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  31.3 
 
 
243 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  29.84 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  28.52 
 
 
254 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
637 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.58 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.98 
 
 
253 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  32.49 
 
 
663 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
250 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
251 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
259 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.74 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
250 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  25.38 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  27.75 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  27.31 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  27.31 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.91 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.19 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.19 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  27.19 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.19 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  27.19 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.97 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
675 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.32 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.32 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
638 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  35.19 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.35 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  24.76 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  25.11 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  25.35 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.31 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  24.8 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  25.35 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  25.46 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.46 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  26.54 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  26.07 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  27.14 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  27.6 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.19 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  25.59 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  24.88 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  25.57 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  25.59 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  25.59 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  25.59 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  26.15 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  22.44 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  25.59 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  25.87 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  24.05 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  25.33 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  25.12 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  23.88 
 
 
541 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  24.4 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  28.95 
 
 
222 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  22.89 
 
 
541 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  21.05 
 
 
262 aa  58.5  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  24.3 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  23.66 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>