More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2289 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2289  recombinase A  100 
 
 		 350 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2561  recombinase A  88.51 
 
 		 348 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0241  recombinase A  88.18 
 
 		 353 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000059491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2133  recombinase A  90.23 
 
 		 350 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0275  recombinase A  88.92 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.19839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  80.29 
 
 		 349 aa  537  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2185  recombinase A  79.48 
 
 		 350 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019841  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  70.25 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  68.73 
 
 		 336 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  70.94 
 
 		 358 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  67.28 
 
 		 335 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  70.25 
 
 		 358 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  70.25 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  69.94 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.11 
 
 		 365 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.36 
 
 		 362 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  67.29 
 
 		 363 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  68.1 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  67.39 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  65.35 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  63.64 
 
 		 379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  66.67 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  67.6 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  65.03 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.98 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.05 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  68.22 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  64.79 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  66.67 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.98 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  66.98 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.25 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.67 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  66.67 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  71.25 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.17 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  66.04 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.04 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  66.56 
 
 		 366 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  66.67 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  67.19 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.67 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  67.4 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  66.98 
 
 		 362 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.95 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  64.33 
 
 		 357 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.63 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  67.18 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  65.73 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.03 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.98 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  67.18 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.25 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  65.63 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  64.76 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  66.67 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  68.24 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.74 
 
 		 343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  64.72 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  65.63 
 
 		 364 aa  441  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  62.95 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  62.2 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  66.04 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.94 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  64.24 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  66.14 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  65.73 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  65.42 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  65.83 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  64.62 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.31 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  65.17 
 
 		 359 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  64.71 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  64.71 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.09 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  66.77 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  63.86 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  65.02 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  65.02 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  65.12 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  67.89 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  65.02 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  63.24 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  65.83 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  64.89 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  67.5 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  67.52 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  63.03 
 
 		 348 aa  434  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  65.26 
 
 		 342 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  63.89 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  64.89 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  66.13 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  64.09 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  63.64 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  61.37 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  65.35 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  68.17 
 
 		 368 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  60.43 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  67.31 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  64.4 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>