More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2133 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2133  recombinase A  100 
 
 		 350 aa  703    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2561  recombinase A  87.36 
 
 		 348 aa  596  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2289  recombinase A  90.23 
 
 		 350 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0241  recombinase A  84.81 
 
 		 353 aa  578  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000059491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0275  recombinase A  87.03 
 
 		 348 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.19839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2185  recombinase A  78.1 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019841  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  79.71 
 
 		 349 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  69.94 
 
 		 347 aa  474  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  68.42 
 
 		 336 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  70.06 
 
 		 365 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  67.91 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.91 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  70.62 
 
 		 358 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.67 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  70.31 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  65.74 
 
 		 335 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  67.29 
 
 		 361 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  67.91 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  69.94 
 
 		 358 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.97 
 
 		 363 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  68.12 
 
 		 357 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  67.91 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  67.91 
 
 		 343 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.67 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.36 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  66.04 
 
 		 362 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  67.5 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  66.06 
 
 		 364 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.36 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  66.57 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.56 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  64.12 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.36 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  68.1 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  70 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  68 
 
 		 337 aa  455  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  66.36 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  69.59 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  66.36 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  68.42 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  65.75 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.06 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  66.36 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  69.59 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  66.67 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  64.72 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  66.67 
 
 		 348 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.95 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.25 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  64.85 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  65.85 
 
 		 352 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  65.54 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.67 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  66.77 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  63.8 
 
 		 364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  65.11 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  63.55 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.73 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  66.46 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  65.23 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  66.14 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  66.05 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  65.17 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  67.19 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  66.36 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  63.19 
 
 		 379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.17 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  63.55 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  64.4 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  66.25 
 
 		 359 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  65.12 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  66.47 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  65.83 
 
 		 364 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  64.37 
 
 		 342 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  66.77 
 
 		 341 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  64.44 
 
 		 345 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  62.69 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  63.36 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.89 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  66.47 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  64.71 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  63.66 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  64.71 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  64.4 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  65.74 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  66.57 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  62.5 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  64.44 
 
 		 345 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  64.71 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  65.2 
 
 		 378 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  65.34 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  66.67 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  61.27 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  66.36 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>