More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0662 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  83.61 
 
 
244 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  83.2 
 
 
244 aa  417  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  81.56 
 
 
244 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  79.51 
 
 
244 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  79.01 
 
 
244 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  78.6 
 
 
244 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.96 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  44.54 
 
 
248 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.86 
 
 
248 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.24 
 
 
266 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
248 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
248 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  42.72 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 
306 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  38.84 
 
 
271 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  39.06 
 
 
293 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40.42 
 
 
255 aa  191  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 
262 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
421 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  38.63 
 
 
286 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.5 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  38.63 
 
 
286 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
254 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  40 
 
 
273 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 
267 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  39.06 
 
 
273 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
273 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  39.06 
 
 
273 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
264 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  39.06 
 
 
273 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.83 
 
 
270 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
296 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  38.96 
 
 
277 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.26 
 
 
248 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  38.63 
 
 
273 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.35 
 
 
333 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  38.2 
 
 
273 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  38.2 
 
 
273 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
272 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  40.26 
 
 
397 aa  184  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 
278 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.24 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.2 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  37.77 
 
 
286 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
248 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  38.2 
 
 
273 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03231  ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.91104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  36.71 
 
 
282 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
397 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  34.6 
 
 
276 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.63 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  39.22 
 
 
309 aa  178  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  40.08 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
275 aa  178  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  40.35 
 
 
251 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.43 
 
 
248 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
248 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  40.69 
 
 
267 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  39.76 
 
 
262 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
289 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  38.2 
 
 
273 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  38.82 
 
 
273 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  36.75 
 
 
249 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  38.36 
 
 
282 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  41.04 
 
 
261 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39.5 
 
 
378 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  41.04 
 
 
261 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  38.91 
 
 
359 aa  175  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.83 
 
 
272 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  38.26 
 
 
270 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  39.39 
 
 
272 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  37.6 
 
 
260 aa  174  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  36.91 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.57 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  36.1 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  39.39 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  37.55 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  39.83 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  37.13 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  37.93 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  37.13 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  37.13 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  39.83 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  36.82 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  37.13 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  44.3 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  37.96 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  38.96 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  37.13 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>