More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1139 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1139  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
380 aa  766    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.422964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1125  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.51 
 
 
380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2215  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.32 
 
 
378 aa  300  2e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.46 
 
 
368 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.37 
 
 
370 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.36 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.47 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.86 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.29 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
388 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.32 
 
 
425 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.85 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4577  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.21 
 
 
360 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  27.35 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.18 
 
 
390 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.93 
 
 
390 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 
403 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  30.64 
 
 
382 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 
382 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.97 
 
 
390 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
423 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  28.25 
 
 
382 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6032  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.42 
 
 
395 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.53 
 
 
410 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.29 
 
 
372 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.13 
 
 
384 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
390 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1155  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.96 
 
 
412 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  27.87 
 
 
384 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2257  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.63 
 
 
372 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.59 
 
 
387 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2226  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.08 
 
 
366 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.706193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.11 
 
 
381 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  27.62 
 
 
382 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  27.62 
 
 
382 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  27.62 
 
 
382 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 
390 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2242  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.76 
 
 
412 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.464149  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  28.12 
 
 
391 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.73 
 
 
390 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.19 
 
 
390 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.19 
 
 
390 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.93 
 
 
381 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.27 
 
 
406 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 
401 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.84 
 
 
382 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.07 
 
 
373 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  25.56 
 
 
391 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  27.15 
 
 
382 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.28 
 
 
382 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.45 
 
 
393 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
398 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1145  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.56 
 
 
412 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.58 
 
 
378 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.17 
 
 
417 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.15 
 
 
386 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
388 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
398 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.13 
 
 
393 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 
382 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
398 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  27.34 
 
 
382 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 
390 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2654  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.65 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  26.26 
 
 
382 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.05 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 
384 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.6 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.24 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  25.87 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.87 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1300  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.02 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  25.87 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  25.87 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  25.87 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.73 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  25.87 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  25.87 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.84 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0074  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.23 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.19 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.33 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.33 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.33 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.33 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4429  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.19 
 
 
396 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.43 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.49 
 
 
396 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2709  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.01 
 
 
398 aa  96.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0606445  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3948  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.3 
 
 
451 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  26.46 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
412 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  25.87 
 
 
382 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>