More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0821 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
405 aa  830    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2579  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  81.73 
 
 
405 aa  695    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1300  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.29 
 
 
412 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.92 
 
 
428 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.967336  normal  0.603396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2654  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.17 
 
 
412 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1145  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.29 
 
 
412 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4480  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.32 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2242  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.17 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.464149  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.83 
 
 
412 aa  412  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1155  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.28 
 
 
412 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.49 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.84 
 
 
410 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50 
 
 
411 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  45.32 
 
 
417 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  42.86 
 
 
400 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.56 
 
 
425 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0789  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.28 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6070  Galactonate dehydratase  32.35 
 
 
474 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430107  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1106  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.71 
 
 
494 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940832  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4860  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.605322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3672  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.39 
 
 
453 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.18 
 
 
388 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.74 
 
 
387 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.62 
 
 
388 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.06 
 
 
390 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 
392 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.42 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679243  normal  0.849067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.45 
 
 
403 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.2 
 
 
403 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.09 
 
 
395 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.41 
 
 
391 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.69 
 
 
388 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1665  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.09 
 
 
406 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0687285  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  33.25 
 
 
384 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.01 
 
 
381 aa  180  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4859  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.66 
 
 
399 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156633  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.61 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  32.08 
 
 
382 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3671  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 
388 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4861  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 
388 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.26 
 
 
382 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.59 
 
 
415 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.23 
 
 
386 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.57 
 
 
410 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.95 
 
 
387 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5183  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.07 
 
 
395 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00282552  normal  0.155214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3673  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.54 
 
 
399 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406151  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.71 
 
 
400 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.46 
 
 
391 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1992  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.39 
 
 
405 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.589725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5452  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.64 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168322  normal  0.041032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  31.55 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2909  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.59 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  30.97 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  30.97 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  31.04 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  30.73 
 
 
381 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.85 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.93 
 
 
391 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.15 
 
 
373 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.81 
 
 
398 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.93 
 
 
382 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  29.6 
 
 
382 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
384 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  31.48 
 
 
382 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.31 
 
 
370 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.05 
 
 
400 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  30.28 
 
 
382 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.67 
 
 
393 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.08 
 
 
406 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  30.53 
 
 
382 aa  166  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  29.74 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.42 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  31.14 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.49 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  31.08 
 
 
401 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  30.97 
 
 
400 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  30 
 
 
382 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  30.97 
 
 
400 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.29 
 
 
401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  30.97 
 
 
400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.14 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  31.55 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  30.03 
 
 
382 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  30.03 
 
 
382 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.19 
 
 
372 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  30.03 
 
 
382 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  30.03 
 
 
382 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  32.23 
 
 
392 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1074  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30 
 
 
394 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.3 
 
 
396 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  30.85 
 
 
381 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  30.08 
 
 
502 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  31.04 
 
 
382 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0074  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.12 
 
 
395 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.3 
 
 
396 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  32.05 
 
 
382 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  30.16 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  30.16 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>