More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2226 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2226  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
366 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.706193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4499  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.54 
 
 
367 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0846  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  41.87 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122674  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.34 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  29.48 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.51 
 
 
388 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.27 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 
388 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.86 
 
 
377 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 
372 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.81 
 
 
391 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.64 
 
 
398 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.57 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0074  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.2 
 
 
395 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.25 
 
 
382 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3433  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.65 
 
 
381 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428257  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.1 
 
 
382 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0935  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.45 
 
 
395 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5534  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.28 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.28 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0244  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.53 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0781522  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.45 
 
 
398 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.06 
 
 
410 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.53 
 
 
400 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  30.23 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  30.96 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  29.1 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.41 
 
 
415 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.38 
 
 
390 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.72 
 
 
370 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.28 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.13 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2654  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.8 
 
 
412 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.67 
 
 
381 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.32 
 
 
381 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.4 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  26.57 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  26.57 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.65 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.75 
 
 
379 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.41 
 
 
395 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.19 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.03 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  28.88 
 
 
378 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.42 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  30.54 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  30.16 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.28 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.14 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.38 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  30.54 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  29.43 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  28.96 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 
423 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  28.13 
 
 
384 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  30.16 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  30.16 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  30.94 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  30.08 
 
 
382 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  29.89 
 
 
382 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  29.89 
 
 
382 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.21 
 
 
382 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  30.27 
 
 
382 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  30.27 
 
 
382 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  30.27 
 
 
382 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  30.27 
 
 
382 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.87 
 
 
370 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  26.22 
 
 
391 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  28.53 
 
 
382 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.55 
 
 
411 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.62 
 
 
403 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.45 
 
 
390 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0909  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.98 
 
 
433 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598164  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  28.93 
 
 
382 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5452  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
395 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168322  normal  0.041032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.8 
 
 
370 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1145  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.22 
 
 
412 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  28.93 
 
 
382 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.82 
 
 
386 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  28.88 
 
 
382 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  29.95 
 
 
381 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.91 
 
 
406 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  27.43 
 
 
382 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4290  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.63 
 
 
385 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0251584  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.9 
 
 
390 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5183  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
395 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00282552  normal  0.155214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.9 
 
 
390 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  28.37 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  29.86 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.98 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.93 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  28.37 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  26.17 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.22 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.21 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1300  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.43 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.7 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.1 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>