More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0909 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0909  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
433 aa  848    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4410  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.59 
 
 
429 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164749  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.49 
 
 
412 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.213701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3948  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.99 
 
 
451 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0947  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.39 
 
 
417 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1377  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.61 
 
 
438 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1008  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.6 
 
 
450 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.570237  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1541  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, C- domain protein  44.64 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315954  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5328  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.33 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0977  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.05 
 
 
399 aa  309  5e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000913378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.23 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.36 
 
 
415 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0192  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.13 
 
 
399 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.04 
 
 
399 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.851358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4063  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.99 
 
 
399 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  43.9 
 
 
402 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.41 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4722  Galactonate dehydratase  41.56 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44454  normal  0.932737 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0510  starvation sensing protein RspA  42.6 
 
 
402 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03730  D-mannonate dehydratase  42.32 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2096  starvation sensing protein RspA  42.6 
 
 
402 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2001  starvation sensing protein RspA  42.6 
 
 
402 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.67 
 
 
403 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0553665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.82 
 
 
402 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0037  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.34 
 
 
403 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0766  starvation sensing protein RspA  42.08 
 
 
402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0583  starvation sensing protein RspA  42.08 
 
 
402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0980874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0694  starvation sensing protein RspA  42.08 
 
 
402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.58786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1648  starvation sensing protein RspA  42.08 
 
 
402 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.34 
 
 
402 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316488  normal  0.738385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.08 
 
 
402 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  41.79 
 
 
423 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0398096  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1364  starvation sensing protein  40.26 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.185612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1424  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme  40.26 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.34 
 
 
405 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02420  D-mannonate dehydratase  42.55 
 
 
402 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296933  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3563  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.76 
 
 
404 aa  272  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851149  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1036  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.02 
 
 
404 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.5 
 
 
404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.24 
 
 
404 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0802  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.76 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2974  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.86 
 
 
403 aa  269  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2635  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.5 
 
 
404 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0759429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1427  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.74 
 
 
403 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4500  starvation sensing protein  38.5 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.244455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03854  starvation sensing protein  41.71 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0790  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.5 
 
 
409 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3978  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.7 
 
 
403 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2883  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.96 
 
 
403 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0617503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1889  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.22 
 
 
402 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0204033  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01550  predicted dehydratase  37.47 
 
 
404 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2062  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.47 
 
 
404 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0579559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01540  hypothetical protein  37.47 
 
 
404 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1654  starvation-sensing protein RspA  37.47 
 
 
404 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0315691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2049  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.47 
 
 
404 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.362051  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1788  starvation-sensing protein RspA  37.47 
 
 
404 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1619  starvation-sensing protein RspA  37.47 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000210785  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0048  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.74 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.396103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.04 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3561  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.7 
 
 
431 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3278  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.41 
 
 
403 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1004  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.64 
 
 
403 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.123594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4132  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40 
 
 
407 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0168136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1675  starvation sensing protein RspA  37.98 
 
 
404 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2983  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.59 
 
 
411 aa  259  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0331585  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1607  starvation sensing protein RspA  37.98 
 
 
404 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1834  starvation sensing protein RspA  37.73 
 
 
404 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.768737  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1667  starvation sensing protein RspA  37.73 
 
 
404 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3318  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.46 
 
 
411 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.38 
 
 
402 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000550231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1616  starvation sensing protein RspA  37.47 
 
 
404 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1064  galactokinase  36.62 
 
 
402 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32364  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0504  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.72 
 
 
409 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.05 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.73485  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2407  mandelate racemase/muconate-lactonizing protein  36.73 
 
 
409 aa  253  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360808  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3675  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40 
 
 
402 aa  252  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.32 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01410  D-mannonate dehydratase  38.66 
 
 
412 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.14 
 
 
388 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.85 
 
 
381 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  32.88 
 
 
382 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  33.6 
 
 
382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  33.6 
 
 
382 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  33.6 
 
 
382 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.14 
 
 
392 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  32.98 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  32.65 
 
 
384 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.91 
 
 
384 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  33.07 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  33.07 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  33.07 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  32.55 
 
 
382 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  34.79 
 
 
381 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  32.81 
 
 
502 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.06 
 
 
400 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>