More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3848 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 388 aa  800    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.78 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.48 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  42.36 
 
 		 382 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  42.64 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.27 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.03 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  41.5 
 
 		 382 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  43.75 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  42.26 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  41 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  42 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.97 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  41.83 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  41.79 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  41.75 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  40.8 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  40.85 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  41.35 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  40.8 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  41.18 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.49 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  41.85 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  41.85 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  41.85 
 
 		 382 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  41.6 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  41.6 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  41.6 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  41.85 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.64 
 
 		 395 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  41.1 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  41.6 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  41.6 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  41.6 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  41.35 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  38.25 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  41.35 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  41.35 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  41.35 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  41.35 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.9 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.6 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  40.1 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.82 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  41.1 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.63 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  43.36 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  40.6 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  42.5 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  39.9 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.4 
 
 		 381 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  40.36 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  36.84 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  37.09 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.09 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  38.85 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.69 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  40.1 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  37.09 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  37.09 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  37.09 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  37.09 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  40.4 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.44 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  37.59 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  37.09 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  40.3 
 
 		 381 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  36.84 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  36.84 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  42.82 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  36.84 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  40.4 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5329  galactonate dehydratase  41.25 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  38.1 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4412  galactonate dehydratase  40.21 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.737612  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.27 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  40 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.27 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.25 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.32 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.5 
 
 		 403 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.5 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3772  galactonate dehydratase  38.35 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.11 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679243  normal  0.849067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.57 
 
 		 411 aa  230  4e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1992  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.61 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.589725 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.3 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4035  galactonate dehydratase  41.08 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.68 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  34.18 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  34.18 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.49 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  35.41 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.78 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.15 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  38.63 
 
 		 410 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.95 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.75 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02060  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  36.96 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5183  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.64 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00282552  normal  0.155214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>