More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2257 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2257  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
372 aa  766    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.1 
 
 
401 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.03 
 
 
390 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0174  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.31 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  37.72 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.93 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.06 
 
 
390 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.06 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.06 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.93 
 
 
390 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  37.02 
 
 
391 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  40.24 
 
 
390 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.24 
 
 
390 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.24 
 
 
390 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09220  Mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.87 
 
 
394 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.986442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.07 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.21 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1493  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.31 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227667  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3926  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
409 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2709  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.26 
 
 
398 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0606445  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1207  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.21 
 
 
392 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6403  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.75 
 
 
392 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.75 
 
 
392 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.75 
 
 
392 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297392  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02173  predicted enolase  31.09 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1411  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.09 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02132  hypothetical protein  31.09 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1402  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.09 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.25889  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3468  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.81 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3399  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.65 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.645647  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2401  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.01 
 
 
401 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2389  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
405 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.99 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1685  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.5 
 
 
400 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322016  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5689  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.37 
 
 
392 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.905556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.67 
 
 
422 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1030  putative mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.09 
 
 
392 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778904  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3388  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.53 
 
 
401 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6625  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.69 
 
 
394 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2519  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.45 
 
 
401 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.45 
 
 
401 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267716  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2635  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.45 
 
 
401 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.944785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2531  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.45 
 
 
401 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2427  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.45 
 
 
401 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05672  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04350)  28.93 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0812172  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05750  racemase, putative  29.38 
 
 
423 aa  159  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0461425  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50672  hypothetical protein unknown function  28.61 
 
 
429 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.482129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.46 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.71 
 
 
370 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.38 
 
 
375 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.28 
 
 
375 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.09 
 
 
384 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.18 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0244  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.86 
 
 
383 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0781522  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.72 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.46 
 
 
382 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.27 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.76 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.37 
 
 
391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.33 
 
 
403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  31.99 
 
 
384 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  32.61 
 
 
382 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.84 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0466  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.97 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.83 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.98 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  31.62 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.02 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  34.66 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.49 
 
 
382 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  32.49 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  32.35 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  32.72 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  33.09 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.38 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.83 
 
 
403 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  32.61 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  32.97 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.09 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  32.97 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  28.78 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1125  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.75 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.58 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  28.78 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10599  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05520)  33.98 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185657  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  32.97 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2580  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.42 
 
 
369 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>