More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1685 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1685  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
400 aa  797    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322016  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3926  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.01 
 
 
409 aa  297  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38 
 
 
401 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5689  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.77 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.905556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1030  putative mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.77 
 
 
392 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778904  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3399  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.23 
 
 
392 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.645647  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.96 
 
 
392 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297392  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1207  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.96 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6403  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.69 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.69 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1493  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.51 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227667  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3468  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.07 
 
 
392 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.06 
 
 
388 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09220  Mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.32 
 
 
394 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.986442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6625  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.22 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.49 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.69 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.71 
 
 
373 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.19 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.37 
 
 
378 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2257  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.5 
 
 
372 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  33.83 
 
 
391 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  33.05 
 
 
391 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.8 
 
 
389 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05750  racemase, putative  30.61 
 
 
423 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0461425  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.03 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.81 
 
 
372 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0174  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.53 
 
 
398 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.72 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.03 
 
 
390 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.03 
 
 
390 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50672  hypothetical protein unknown function  27.6 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.482129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
390 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.98 
 
 
390 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.53 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.89 
 
 
378 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2401  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.47 
 
 
401 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2531  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.26 
 
 
401 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2389  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.47 
 
 
405 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2427  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
401 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2635  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
401 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.944785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
401 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267716  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2519  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
401 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3388  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.28 
 
 
401 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.86 
 
 
370 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02173  predicted enolase  29.21 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02132  hypothetical protein  29.21 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1411  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.21 
 
 
401 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1402  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.21 
 
 
401 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.25889  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  32.2 
 
 
382 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05672  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04350)  29.36 
 
 
425 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0812172  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  31.64 
 
 
382 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  31.64 
 
 
382 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  33.05 
 
 
382 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  32.96 
 
 
502 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  33.24 
 
 
382 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  33.24 
 
 
382 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  33.52 
 
 
382 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  33.52 
 
 
382 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  33.52 
 
 
382 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  33.52 
 
 
382 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.82 
 
 
403 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  33.52 
 
 
382 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  33.52 
 
 
382 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.11 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  32.96 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  32.96 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  32.96 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  32.96 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  31.39 
 
 
382 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1460  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.69 
 
 
403 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  31.77 
 
 
382 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  33.24 
 
 
382 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2709  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
398 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0606445  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
403 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.58 
 
 
373 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  32.96 
 
 
381 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  32.32 
 
 
382 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.81 
 
 
377 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3671  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.3 
 
 
388 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.68 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  32.11 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4861  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.02 
 
 
388 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  31.44 
 
 
382 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  32.12 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.43 
 
 
387 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.96 
 
 
389 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  29.6 
 
 
382 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  32.3 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 
382 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.55 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
398 aa  133  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  29.48 
 
 
381 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  34.42 
 
 
382 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.58 
 
 
382 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.85 
 
 
382 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  29.77 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7855  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.2 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>