More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3926 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3926  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 409 aa  837    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1685  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.01 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.83 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  41.06 
 
 		 390 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.79 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  40.53 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  41.23 
 
 		 390 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.23 
 
 		 390 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.35 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  41.37 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.94 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  40.29 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.94 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.06 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2709  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.57 
 
 		 398 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0606445  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.16 
 
 		 391 aa  222  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1207  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.08 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5689  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.24 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.905556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1030  putative mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.92 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778904  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6625  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.92 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0174  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.86 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09220  Mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.33 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.986442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3399  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.52 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.645647  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1493  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.85 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3468  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.89 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128866 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6403  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.76 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.76 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05750  racemase, putative  34.2 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0461425  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.01 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.28 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50672  hypothetical protein unknown function  32.35 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.482129 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.59 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2257  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.05 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.38 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.3 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.18 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.43 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05672  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04350)  35.05 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0812172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  32.43 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.52 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.96 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.46 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.55 
 
 		 373 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.24 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.04 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.5 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5866  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.7 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.01 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.86 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.17 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  31.15 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.4 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  31.15 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.38 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  33.61 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  31.21 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  31.15 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  31.15 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  31.15 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.76 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.75 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.8 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0120  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.98 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102708  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.87 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  30.32 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  33.33 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2580  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.99 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  32.86 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.43 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  32.86 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  31.32 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  31.32 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  31.32 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  31.23 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.23 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  31.23 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  31.23 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  31.23 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  31.23 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  31.37 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  32.58 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  32.58 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  32.29 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  32.57 
 
 		 502 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  31.23 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  32.58 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  32.58 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  31.55 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.82 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  32.01 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  32.01 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  32.29 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  31.27 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  31.27 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  30.66 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.87 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>