More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0427 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
374 aa  770    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.13 
 
 
182 aa  209  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.09 
 
 
192 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.67 
 
 
196 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.81 
 
 
183 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.41 
 
 
145 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.16 
 
 
144 aa  186  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.12 
 
 
147 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
147 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.09 
 
 
171 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.24 
 
 
170 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.74 
 
 
170 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  49.24 
 
 
174 aa  146  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.24 
 
 
787 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.78 
 
 
794 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  48.89 
 
 
211 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.28 
 
 
170 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.59 
 
 
170 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.59 
 
 
170 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.76 
 
 
176 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  45.65 
 
 
166 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  46.38 
 
 
173 aa  133  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  41.98 
 
 
170 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46 
 
 
163 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46 
 
 
163 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46 
 
 
163 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.32 
 
 
794 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  46.04 
 
 
207 aa  132  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  44.59 
 
 
193 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  48.15 
 
 
191 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.12 
 
 
188 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
193 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  47.01 
 
 
170 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
193 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1956  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  41.67 
 
 
177 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.32 
 
 
794 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
186 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  38.55 
 
 
190 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.01 
 
 
167 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  38.69 
 
 
173 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  44.6 
 
 
228 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  28.5 
 
 
792 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  47.41 
 
 
193 aa  130  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0335  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.6 
 
 
177 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.29537  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  43.57 
 
 
190 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
190 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  43.57 
 
 
190 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  43.06 
 
 
185 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.74 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
204 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  47.41 
 
 
188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  42.86 
 
 
168 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  48.51 
 
 
160 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  46.27 
 
 
170 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  48.51 
 
 
160 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
199 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.75 
 
 
176 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
192 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
179 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
179 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
179 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
198 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.8 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
201 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.67 
 
 
187 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  45.14 
 
 
172 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  43.8 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.27 
 
 
169 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  28.84 
 
 
793 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  45.19 
 
 
195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
172 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.14 
 
 
188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  45.19 
 
 
197 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  42.14 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  42.14 
 
 
189 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
202 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  43.7 
 
 
188 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  45.19 
 
 
194 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  45.19 
 
 
194 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  45.19 
 
 
194 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  45.19 
 
 
195 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  43.04 
 
 
167 aa  127  3e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
174 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4632  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
194 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625417  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  42.14 
 
 
189 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  42.14 
 
 
189 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  43.79 
 
 
213 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  42.68 
 
 
174 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  42.68 
 
 
176 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.19 
 
 
180 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  45.93 
 
 
177 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  41.77 
 
 
184 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
170 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>