More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0641 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  71.32 
 
 		 257 aa  353  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  71.71 
 
 		 257 aa  353  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  71.32 
 
 		 257 aa  353  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  60.62 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  60.17 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  61.11 
 
 		 273 aa  298  4e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  59.92 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  56.59 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  56.59 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  55.56 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  57.98 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  55.56 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  55.16 
 
 		 262 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  56.42 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  55.08 
 
 		 260 aa  274  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  55.88 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  54.3 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  51.95 
 
 		 260 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  54.81 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  52.53 
 
 		 256 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  57.2 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  53.72 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  52.14 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  52.14 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  50.97 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  54.72 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  54.72 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  54.17 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  52.48 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  56.3 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  51.94 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  54.17 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  52.48 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  54.17 
 
 		 261 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  52.97 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  53.16 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  53.75 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  55.51 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  52.5 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  53.23 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  52.5 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  50.62 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  50.77 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  50 
 
 		 259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  53.75 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  52.42 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  49.58 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  48.64 
 
 		 284 aa  248  7e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  48.64 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  49.59 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  52.46 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  48.08 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  50.62 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  48.3 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  47.69 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  47.69 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  51.21 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.55 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  50.63 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.42 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  46.79 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  46.89 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  46.79 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.42 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  46.79 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  46.88 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.74 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  49.18 
 
 		 277 aa  235  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  46.69 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  45.45 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  47.04 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  46.91 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  46.91 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.91 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.91 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.91 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.91 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.91 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  47.68 
 
 		 261 aa  228  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.5 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  46.89 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  45.87 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  47.31 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  47.31 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  47.01 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  47.97 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  46.61 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  44.62 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  46.61 
 
 		 272 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  41.86 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  45.04 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  41.86 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  46.99 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  45.25 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  45.25 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>