223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1179 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 184 aa  352  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  54.1 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  53.76 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  53.23 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  53.51 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  51.6 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  47.4 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  48.37 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  48.07 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  50.83 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  46.2 
 
 		 196 aa  148  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  49.21 
 
 		 205 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  49.19 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  45.56 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  45.65 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  44.2 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  44.2 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  44.2 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  44.2 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  43.09 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  48.65 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  40.88 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  40.54 
 
 		 209 aa  130  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  40.88 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  39.23 
 
 		 225 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.71 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  38.92 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  31.52 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  29.51 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  26.78 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  35.68 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  28.18 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  29.35 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  30.94 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  31.52 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  37.71 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  32.04 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  30 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  30.05 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.26 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  30.05 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  30.05 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  30.6 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  32.96 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  29.57 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  26.52 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  32.11 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  27.84 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1377  hypothetical protein  34.93 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  28.96 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  33.16 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  33.15 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  30.68 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  31.89 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  29.68 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  28.25 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  30.07 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  29.27 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  31.18 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  26.95 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  29.78 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  25.41 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.99 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  30.41 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  31.18 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  25.68 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  30.73 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  31.18 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  29.3 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  29.3 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  25.13 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  26.92 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  28.26 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  30.81 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  31.49 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  30.22 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  29.49 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.05 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  29.49 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  31.36 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  30.98 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  25.84 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  30.89 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  25.42 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>