More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  59.68 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  50.74 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  49.43 
 
 		 278 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  47.25 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  46.89 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  44.57 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  41.44 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.49 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  46.67 
 
 		 260 aa  223  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  41.06 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  43.57 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  42.91 
 
 		 281 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.4 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  45.35 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  43.54 
 
 		 260 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  41.54 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  46.53 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  46.06 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  42.8 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.29 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  45.42 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  45 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  46.89 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  45.42 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  41.39 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  45.42 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  45 
 
 		 256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  39.69 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1131  NLPA lipoprotein  45.04 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  46.06 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  45.35 
 
 		 273 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  43.36 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  42.29 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0627  NLPA lipoprotein  39 
 
 		 264 aa  211  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  42.59 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  40.45 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  42.57 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  40.93 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  39.15 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  40.07 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.58 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  44.44 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  40.93 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  44.44 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  44.92 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  45.27 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  44.31 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.85 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  43.93 
 
 		 262 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  43.62 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  40.89 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  44.17 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.42 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  38.4 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  43.03 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  43.16 
 
 		 260 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  43.36 
 
 		 258 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  43.07 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  43.07 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  42.97 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  42.39 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  43.21 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  42.7 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  41.5 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.32 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  41.82 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  41.82 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  41.39 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  41.39 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  41.39 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  43.28 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  42.44 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  42.44 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  39.01 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  43.8 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  37.91 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.47 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  37.91 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  45.99 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.23 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.98 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  43.32 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  42.8 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  43.15 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  39.92 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  41.5 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  40.86 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  43.51 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  42.19 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  42.44 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  42.19 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  45.64 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.32 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.32 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.32 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.32 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.32 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  39.7 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  41.67 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>