205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1868 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  100 
 
 
215 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  45.54 
 
 
221 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  37.44 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  35.21 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  33.33 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  32.55 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  33.81 
 
 
210 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  32.74 
 
 
377 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  35.07 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  35.07 
 
 
210 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  34.6 
 
 
210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.02 
 
 
216 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  34.12 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  34.12 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  34.12 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  34.12 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  34.6 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  33.96 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  30.91 
 
 
222 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  34.12 
 
 
210 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  31.9 
 
 
214 aa  104  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  34.62 
 
 
219 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  32.86 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  30.99 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.02 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.65 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  31.58 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  31.88 
 
 
217 aa  94.7  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.46 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.11 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.47 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.2 
 
 
214 aa  92  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.91 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  32.43 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  31.1 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.47 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  29.25 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  33.01 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.37 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  28.17 
 
 
229 aa  85.5  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  33.33 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.83 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.34 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  30 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  27.52 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  30.54 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  28.64 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  30.09 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  30.09 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  30.09 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  30.09 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  29.17 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  29.17 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.27 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  28.65 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  30.56 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  28.97 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  28.84 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  31.8 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  29.36 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  30.14 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  29.95 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  30.45 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  29.02 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  27.88 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  28.23 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  27.6 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  29.91 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  30.7 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  28.43 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  28.57 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  26.42 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  28.24 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  24.88 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  31.79 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  25.96 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  27.91 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  24.39 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  29.41 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  25.89 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  29.17 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  27.65 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  27.49 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  27.49 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  25.98 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  28.8 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  24.64 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  26.13 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  27.01 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  26.92 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  26.92 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  27.09 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  26.39 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.7 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  28.65 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  28.51 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  26.6 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  26.6 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  28.57 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  28.77 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>