More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4887 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  100 
 
 		 511 aa  993    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.13 
 
 		 521 aa  547  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  58.09 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  57.69 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.12 
 
 		 515 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  60 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.76 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  58.04 
 
 		 526 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  58.08 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  56.04 
 
 		 520 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  60.09 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  55.85 
 
 		 520 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  61.99 
 
 		 520 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  57.86 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.71 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  63.7 
 
 		 513 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  58.63 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  59.86 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.86 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  62.41 
 
 		 521 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  59.95 
 
 		 551 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  58.64 
 
 		 516 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  61.48 
 
 		 522 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  57.7 
 
 		 457 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  60.19 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.3 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  60.28 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  57.68 
 
 		 540 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  58.72 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  57.82 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  53.69 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  60.28 
 
 		 523 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.3 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  59.62 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.09 
 
 		 501 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.68 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  60.56 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  54.59 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  62.15 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  60.09 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  54.59 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  59.35 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  60.98 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.56 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  54.3 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  55.29 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  55.29 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  55.29 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  55.29 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  53.39 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  55.29 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  51.94 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  54.82 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  54.59 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  54 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  54 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.95 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51 
 
 		 511 aa  425  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  53.55 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  53.56 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  52.87 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.63 
 
 		 457 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.1 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  51.25 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  52.46 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  54.23 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  50.22 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  53.88 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  53.65 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000129048  hitchhiker  0.0000234744 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  50.99 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  51.21 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  51.21 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  50.99 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  52.46 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  54 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  52.11 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  49.78 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.99 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  50.99 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  53.55 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>