131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4612 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  100 
 
 		 416 aa  815    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  71.32 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  43.05 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  35.04 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  34.27 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  34.28 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  30.41 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  30.17 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  31.34 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  31.34 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  31.92 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  31.92 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  31.92 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  31.92 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  31.92 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  30.49 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  32.88 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  31.53 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  30.98 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  31.66 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  29.85 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  32.68 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  29.01 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  31.64 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  32.71 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  31.37 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  28.64 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  29.95 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  28.21 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  28.74 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  27.96 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  29.69 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  29.86 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  29.86 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  29.69 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  29.69 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  28.76 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  28.77 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  28.77 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  26.74 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  27.38 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  27.32 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  26.21 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  25.98 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  25.75 
 
 		 418 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.93 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  25 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  19.37 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  22.41 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  25.3 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  22.39 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  21.77 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.24 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  25 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  22.98 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0841  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  19.16 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>