More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1542 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  35.91 
 
 		 288 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  34.96 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  36.07 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  34.4 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  32.26 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  32.2 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  26.1 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  22.18 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.89 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  23.6 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  22.57 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  22.57 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  25.3 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  22.62 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  25.59 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  23.44 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  22.98 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  22.48 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  25.9 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  22.94 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  24.02 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  21.26 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  21.79 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  22.27 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  22.58 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  19.44 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  23.25 
 
 		 290 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  19.74 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  21.12 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>