182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2483 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
291 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  59.79 
 
 
293 aa  333  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  58.66 
 
 
281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 
271 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  40.45 
 
 
271 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  57.94 
 
 
306 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  56.35 
 
 
315 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  47.85 
 
 
358 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  55.38 
 
 
295 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  54.76 
 
 
653 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  51.52 
 
 
272 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  51.35 
 
 
509 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  58.73 
 
 
445 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  54.14 
 
 
653 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  54.01 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  46.82 
 
 
439 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  54.2 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  56.2 
 
 
286 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  53.44 
 
 
292 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  48.61 
 
 
667 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  50.69 
 
 
430 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  50.34 
 
 
428 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  52.67 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  38.25 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  36.07 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  42.68 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  46.21 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  50.76 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  49.62 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  51.26 
 
 
653 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  40.99 
 
 
283 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  47.24 
 
 
562 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  46.98 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  50.78 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  50.34 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  46.81 
 
 
388 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  42.21 
 
 
280 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 
288 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  52.54 
 
 
323 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  34.8 
 
 
286 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  48.36 
 
 
655 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  48.03 
 
 
357 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  42.77 
 
 
559 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  48.55 
 
 
433 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  44.83 
 
 
568 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 
549 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
279 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.26 
 
 
284 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  48.46 
 
 
282 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  38.61 
 
 
424 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.54 
 
 
294 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  51.69 
 
 
429 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  33.21 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  45.62 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  45.16 
 
 
372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.32 
 
 
285 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  39.47 
 
 
538 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  34.2 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  44.03 
 
 
361 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  45.07 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  43.15 
 
 
286 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  45.24 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  42.2 
 
 
388 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 
556 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  45.19 
 
 
549 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  45.6 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  45.53 
 
 
689 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  45.26 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  36.42 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  44.8 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  52.14 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  41.86 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  44.72 
 
 
325 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  46.15 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  41.56 
 
 
521 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  41.27 
 
 
252 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  47.5 
 
 
421 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  39.74 
 
 
694 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  45.83 
 
 
357 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  39.26 
 
 
371 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  43.31 
 
 
231 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 
370 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  43.09 
 
 
361 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 
298 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  48.89 
 
 
425 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  42.54 
 
 
510 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  43.41 
 
 
385 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 
344 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0363  anti-sigma-factor antagonist  41.26 
 
 
279 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.700389  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  41.86 
 
 
342 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  36.41 
 
 
363 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 
359 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 
422 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  42.36 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  40.5 
 
 
365 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>