More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1568 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  917    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  36.6 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 552 aa  170  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 574 aa  163  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 610 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  39.22 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  33.97 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 584 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.44 
 
 		 379 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  36.89 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  34.48 
 
 		 391 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 548 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.39 
 
 		 643 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  34.17 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  39.11 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  34.67 
 
 		 395 aa  126  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 594 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  34.56 
 
 		 388 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  34.86 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  38.34 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 682 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  34.43 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.37 
 
 		 223 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 352 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 545 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 742 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  29.62 
 
 		 622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 725 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.38 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  34.15 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 596 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 682 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 692 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  35.45 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  29.11 
 
 		 622 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  35.75 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.02 
 
 		 598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  34.4 
 
 		 358 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 575 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.93 
 
 		 575 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 575 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  36.86 
 
 		 640 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  32.68 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  36.1 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  36.55 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  36.65 
 
 		 720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 658 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 748 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 599 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  35.61 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  30.7 
 
 		 353 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 652 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  34.13 
 
 		 683 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 546 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  36.79 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.73 
 
 		 740 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  34.25 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 466 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 591 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.8 
 
 		 646 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  35.12 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  37.2 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.29 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 770 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  31.36 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  33.33 
 
 		 474 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 359 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  36.82 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.02 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>