More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0488 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  64.4 
 
 
540 aa  676    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.74 
 
 
547 aa  666    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  85.35 
 
 
544 aa  922    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
546 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  71.24 
 
 
546 aa  759    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.66 
 
 
542 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
546 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.81 
 
 
550 aa  641    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  64.52 
 
 
539 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  63.37 
 
 
541 aa  652    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  63.99 
 
 
544 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
544 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
544 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  63.8 
 
 
541 aa  671    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  64.98 
 
 
542 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.6 
 
 
537 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  82.23 
 
 
547 aa  871    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  65.53 
 
 
538 aa  676    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  61.34 
 
 
536 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
542 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
544 aa  663    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  63.99 
 
 
544 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  63.16 
 
 
539 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
538 aa  640    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.79 
 
 
547 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  64.71 
 
 
539 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.71 
 
 
536 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  62.15 
 
 
544 aa  642    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
539 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.91 
 
 
538 aa  656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  63.72 
 
 
547 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  63.84 
 
 
541 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  60 
 
 
545 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  71.05 
 
 
546 aa  754    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  63.48 
 
 
541 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  64.72 
 
 
541 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0563  chaperonin GroEL  71.11 
 
 
539 aa  732    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
540 aa  641    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.69 
 
 
542 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
542 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
539 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
539 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  63.99 
 
 
544 aa  663    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  63.81 
 
 
544 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
542 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.07 
 
 
546 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
544 aa  663    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  66.91 
 
 
538 aa  703    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
547 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
542 aa  643    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  64.91 
 
 
546 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
543 aa  638    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  63.91 
 
 
538 aa  656    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0968  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
546 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  84.98 
 
 
543 aa  919    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
547 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  66.04 
 
 
538 aa  685    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  63.99 
 
 
544 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1055  chaperonin GroEL  70.68 
 
 
545 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
548 aa  644    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  62.03 
 
 
543 aa  651    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  64.96 
 
 
544 aa  683    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  100 
 
 
546 aa  1071    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
541 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
541 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
543 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
539 aa  653    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
549 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  60.42 
 
 
542 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.9 
 
 
547 aa  633  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  60.45 
 
 
548 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13480  chaperonin GroEL  61.09 
 
 
546 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.434878  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
545 aa  631  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
547 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
544 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
545 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  62.91 
 
 
540 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
540 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  59.44 
 
 
540 aa  629  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.21 
 
 
554 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  59.06 
 
 
552 aa  630  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  60 
 
 
547 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3529  chaperonin GroEL  60.9 
 
 
548 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.249463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2237  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
544 aa  628  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
546 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  60.92 
 
 
539 aa  631  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
553 aa  629  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  60.9 
 
 
547 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  58.92 
 
 
535 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2734  chaperonin GroEL  61.24 
 
 
543 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.657251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4488  chaperonin GroEL  61.09 
 
 
547 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0309413  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  61.13 
 
 
547 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
544 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  59.25 
 
 
552 aa  630  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
548 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05490  chaperonin GroL  59.33 
 
 
543 aa  630  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0308  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
544 aa  628  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.541583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  60 
 
 
547 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
547 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  60.61 
 
 
542 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>