50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1967 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  100 
 
 		 844 aa  1738    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  30.99 
 
 		 849 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  23.97 
 
 		 869 aa  97.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  22.36 
 
 		 880 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  36.7 
 
 		 873 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  29.07 
 
 		 868 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  31.54 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  27.21 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  23.24 
 
 		 872 aa  65.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  23.2 
 
 		 869 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  27.18 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  27.18 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  30.38 
 
 		 781 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  31.43 
 
 		 895 aa  57.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  45.59 
 
 		 891 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  25.24 
 
 		 808 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  41.67 
 
 		 833 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  23.29 
 
 		 710 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  38.1 
 
 		 881 aa  51.6  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  36.59 
 
 		 878 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  20.75 
 
 		 771 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  30.95 
 
 		 792 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  32.28 
 
 		 771 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  24.06 
 
 		 854 aa  49.3  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 643 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  34.44 
 
 		 767 aa  48.5  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  36.36 
 
 		 746 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  32.97 
 
 		 765 aa  48.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  37.5 
 
 		 717 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  34.21 
 
 		 722 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  31.93 
 
 		 892 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  31.72 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  36.99 
 
 		 818 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  36.99 
 
 		 767 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  24.46 
 
 		 721 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  33.68 
 
 		 881 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  31.63 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  31.63 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  21.81 
 
 		 881 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1170 aa  45.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  38.71 
 
 		 877 aa  45.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  23.89 
 
 		 658 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  23.89 
 
 		 640 aa  45.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1168 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  23.89 
 
 		 658 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  32.61 
 
 		 875 aa  44.3  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  24.78 
 
 		 644 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4596  hypothetical protein  27.52 
 
 		 728 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1153 aa  44.3  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.03 
 
 		 493 aa  44.3  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>