More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1470 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
274 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  69.85 
 
 
273 aa  359  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  63.33 
 
 
271 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  60.59 
 
 
273 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  63.6 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  53.01 
 
 
277 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  53.93 
 
 
281 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
281 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
261 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  37.92 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.92 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.37 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  35.76 
 
 
290 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.91 
 
 
277 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 
269 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
262 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  50.76 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.57 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  36.71 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 
296 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.67 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.21 
 
 
306 aa  115  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.67 
 
 
264 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  32.63 
 
 
277 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  29.71 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
295 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
295 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.32 
 
 
306 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.67 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.91 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.32 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  31.39 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
280 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.48 
 
 
263 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.79 
 
 
278 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  39.3 
 
 
284 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  34.8 
 
 
304 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  44.23 
 
 
281 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  38.4 
 
 
285 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  39.3 
 
 
284 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  48.34 
 
 
287 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
264 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 
242 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
258 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
310 aa  105  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
258 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  35.41 
 
 
265 aa  105  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 
283 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
287 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  36.72 
 
 
246 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
288 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 
281 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 
283 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.72 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
266 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
282 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
285 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  30.12 
 
 
303 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
271 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.78 
 
 
285 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.24 
 
 
285 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
261 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
261 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
264 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
268 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
307 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
282 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  47.29 
 
 
285 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  35.83 
 
 
282 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  35.83 
 
 
282 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  33.89 
 
 
280 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
254 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  35.83 
 
 
282 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  35.14 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  32.39 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  35.14 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  35.14 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  35.14 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  35.14 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  44.08 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  34.23 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
279 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 
263 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.79 
 
 
267 aa  99  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>