More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0180 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  100 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  75.8 
 
 		 280 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  75.99 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  74.11 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  73.08 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  70.92 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  70.11 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  44.29 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  47.42 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  47.87 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  43.41 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  42.61 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 358 aa  194  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.43 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.07 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.43 
 
 		 358 aa  192  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  36.75 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.53 
 
 		 632 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.86 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  36.75 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.5 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.79 
 
 		 387 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  36 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.04 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  37.45 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.76 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  38.08 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  36.73 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  32.14 
 
 		 648 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  36.43 
 
 		 360 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  37.01 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  37.81 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.75 
 
 		 360 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  34.75 
 
 		 361 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.65 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  37.01 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  31.54 
 
 		 662 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.69 
 
 		 385 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.69 
 
 		 385 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.69 
 
 		 385 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.4 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35 
 
 		 381 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.26 
 
 		 385 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  32.38 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  39.07 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.13 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.43 
 
 		 396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  37.4 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  31.9 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  31.9 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  34.3 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  35.59 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  34.51 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  35.51 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  35.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  36.76 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2994  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.54 
 
 		 386 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  34.75 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.82 
 
 		 667 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.82 
 
 		 667 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  31.43 
 
 		 662 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.82 
 
 		 667 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  35.94 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>