More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7174 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 417 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  31.2 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.82 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.89 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.89 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.32 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.58 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.04 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.04 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  29.54 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  27.33 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.8 
 
 		 1833 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24.35 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  25.14 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  32.57 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25.26 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.03 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  24.79 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.78 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.29 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.77 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.29 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  31.27 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.32 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  24.89 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.65 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.03 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.92 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  33.99 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.58 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  24.18 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.51 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.42 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  27.17 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.29 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  32.12 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  19.95 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  22.83 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  24.67 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>