More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6720 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 374 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  48.47 
 
 		 360 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  49.43 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  42.61 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.06 
 
 		 339 aa  242  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  42.53 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  41.57 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0918  transcriptional regulator, LacI family  41.38 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  41.21 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  39.59 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.64 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  38.1 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 339 aa  196  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.44 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.44 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.92 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  37.03 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.17 
 
 		 342 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 335 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.43 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  39.89 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.21 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.46 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.28 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 		 332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.36 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.88 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  37.36 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.17 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.9 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.66 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.8 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.68 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.11 
 
 		 347 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  35.55 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  40.69 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.88 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.96 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 334 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.36 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.33 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.24 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.24 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.24 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.99 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.33 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  37.1 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.57 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.96 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.91 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.21 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  37.6 
 
 		 348 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  35.62 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.2 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.78 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  36.9 
 
 		 340 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  36.96 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  35.85 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  38.33 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.14 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 330 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  38.87 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.16 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.91 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.99 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>