More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6149 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  100 
 
 		 328 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  62.86 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.71 
 
 		 302 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  58.79 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  59.68 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  60.76 
 
 		 307 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  58.73 
 
 		 298 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  57.83 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.74 
 
 		 312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 305 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  59.03 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 308 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  57.78 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  57.41 
 
 		 302 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  58.65 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  55.94 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  57.54 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  56.19 
 
 		 302 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  57.99 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 309 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  56.37 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  56.01 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  56.96 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 297 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  55.34 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  49.84 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  49.68 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  54.69 
 
 		 301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  55.13 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  53.04 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  53.35 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  53.35 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  53.35 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  50.49 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  52.92 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.33 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.77 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.12 
 
 		 302 aa  268  8e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  57.47 
 
 		 247 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  48.84 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  48.84 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  48.51 
 
 		 307 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  49.67 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  41.19 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  37.62 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 297 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.09 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38.14 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.28 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.29 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  39.06 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.32 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.44 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  33.33 
 
 		 293 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.19 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.48 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.32 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.62 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.44 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 747 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  36.74 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  36.96 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 250 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  34.86 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  42.99 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  34.08 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  34.98 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.76 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  42.73 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  37.21 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  35.51 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  37.77 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>