More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1394 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 256 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  56.63 
 
 		 206 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  51.79 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  47.46 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  46.08 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  47.47 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  43.72 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  41.86 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  40.51 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.31 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  40.59 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  34.55 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  39.69 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  35.37 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  32.02 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  35.51 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  41.67 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.29 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.65 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.15 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 		 223 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  32.18 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  38.86 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.69 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.79 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  36.9 
 
 		 473 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.13 
 
 		 664 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  34.43 
 
 		 209 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.58 
 
 		 702 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  36.98 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  36.98 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  36.98 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  35.57 
 
 		 355 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  26.07 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  34.84 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.49 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.93 
 
 		 671 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  26.05 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.54 
 
 		 201 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  36.5 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  33.78 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  33.72 
 
 		 199 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.73 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.72 
 
 		 194 aa  88.6  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.39 
 
 		 237 aa  89  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.11 
 
 		 521 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.72 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  26.73 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  31.31 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  31.37 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.87 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  31.18 
 
 		 695 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  31.17 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  31.21 
 
 		 219 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  35.18 
 
 		 214 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.42 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  31.72 
 
 		 202 aa  86.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.21 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  31.17 
 
 		 218 aa  85.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  36.67 
 
 		 209 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.67 
 
 		 668 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  24.35 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  31.45 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.13 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  26.71 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  29.44 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.75 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  26.2 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  32.75 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.8 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  23.83 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  23.83 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.95 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.46 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.48 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  23.83 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  23.32 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  34.67 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.7 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  30 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>